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Partnership

Molecular Modeling Platform - Institute of Molecular and Cellular Biology (Miguel Hernández University).

Objective. The platform for molecular modeling and virtual screening arises as a unit that brings the capabilities of groups in bioinformatics methods based on biomolecular structures. Its mission is to integrate efforts to the use (databases) or the construction of macromolecular structures (homology modeling) to be used for rational protein modification (computer design), to determine protein interaction maps (protein-protein interactions), or to identify novel active compounds (molecular docking and virtual screening) from libraries of compounds (chemical libraries). Additionally, simulation (Molecular Dynamics) recreates the macromolecules in their native environment, including lipids, water and ions.

Synergy and complementarity. The combination of the experimental techniques of high throughput screening (HTS) with computational techniques and virtual screening bioinformatics open ways for high performance research, because the computational in silico calculations determine quickly and economically those families of compounds capable of exerting a biological effect with the chosen targets, whereas with experimental screening techniques the parameters of interaction between ligands and receptors are quantified. Once certain lead compounds, and again using computational techniques, the ligands can be redesigned to increase the specificity of action, the affinity, or both.

Services offered. From Molecular Modeling Platform we offer a variety of services aimed to developing bioactive molecules using computational strategies. The services are offered to research groups or companies interested in using in silico approaches in their research.

1.- Homology modeling.
2.- Protein design.
3.- Protein-protein interaction.
4.- Molecular dynamics.
5.- Molecular docking.
6.- Virtual screening.
7.- Chemical Libraries.

Contact with us.

Dr. Gregorio Fernández-Ballester (IBMC-UMH).
Dr. José Antonio Encinar (IBMC-UMH).
Dr. Vicente Galiano Ibarra (Departamento de Física y Arquitectura de Computadores, UMH).



INNOPHARMA. UNA INICIATIVA DESDE GALICIA PARA EL DESCUBRIMIENTO DE FÁRMACOS

INNOPHARMA es la Plataforma de Farmacogenómica de la Universidad de Santiago de Compostela (USC) aplicada al descubrimiento de fármacos, que integra las capacidades de las Plataformas de Genotipado y de Cribado de Fármacos de la USC, lideradas por los doctores Ángel Carracedo y Mabel Loza respectivamente. Está financiada por el Ministerio de Economía y Competitividad en el marco del Programa Operativo de I+D+I de FONDOS TECNOLÓGICOS 2007-2013. INNOPHARMA pretende aunar las capacidades público/privadas del sector biofarmacéutico a través del establecimiento de colaboraciones estratégicas en un marco de innovación abierta.
Durante el mes de octubre, a través de la página web http://innopharmaplatform.com/, se podrán presentar expresiones de interés, procedentes de los grupos del sector público, para participar en INNOPHARMA.
La convocatoria de expresiones de interés (pre-proyecto) se dirige a poner en valor programas aplicados al descubrimiento de fármacos en colaboración con el sector público. Su objetivo es cubrir el espacio existente entre la investigación básica en nuevos mecanismos terapéuticos y su aplicación industrial.
Para ello, INNOPHARMA financia a través de su plataforma de descubrimiento de fármacos los estudios requeridos para valorizar los resultados de los grupos públicos y desarrollar conjuntamente proyectos en fases tempranas de descubrimiento de fármacos.
Las expresiones de Interés serán evaluadas por un panel de expertos y se seleccionarán para su desarrollo mediante la plataforma INNOPHARMA en base a su nivel de innovación, potencial de transferencia a mercados o a socios industriales y al grado de avance del proyecto en la cadena de valor.

Mabel Loza García
Grupo BioFarma-USEF
Departamento de Farmacología. Facultad de Farmacia
Centro de investigacion CIMUS, 3ª Planta. Avenida de Barcelona s/n
15782 Santiago de Compostela
Tel.:+34 881 815460 ; 881 815005;
E-mail: mabel.loza@usc.es
http://www.usc.es/biofarma
http://imaisd.usc.es/riaidt/usef/index.asp


Dr. José Javier López CascalesEstimados colegas de la Comunidad Biofísica,

Ante la próxima convocatoria de Proyectos de I+D del Ministerio, y la mas que segura dificultad de optar a financiación por parte de grupos pequeños como el mío, busco por esta vía a otros grupos que puedan estar interesados en implementar las simulaciones de dinámica molecular en sus trabajos de investigación, de forma que podamos presentar un proyecto coordinado que aumenten las posibilidades de éxito en dicha convocatoria que se espera altamente competitiva.
Mis lineas de trabajo que mantengo vivas (a pesar de recortes) son las siguientes:
  1. Efecto de la presencia de anestésicos locales sobre las propiedades mecánicas y termodinámicas de la membrana celular, y su relación con su mecanismo molecular de actuación.
  2. Formación de "lipid rafts" como estructura determinante de la actividad de pequeños péptidos antimicrobianos.
  3. Monocapas lipídicas.
  4. H-NMR de cristales líquidos liotrópicos y de pequeñas moléculas disueltas en el cristal.
Por último, indicar que si estáis interesados en mi oferta de colaboración, mis datos de contacto son los siguientes:

Dr. José Javier López Cascales,
Catedrático de Universidad
Universidad Politécnica de Cartagena
Grupo de Bioinformática y Macromoléculas (BioMac)
Teléfono: 968-325567, Fax: 968-325931, email: javier.lopez@upct.es



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